Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRRX2Q99811 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRRX2Q99811 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRRX2Q99811 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRRX2Q99811 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms