Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORT1Q99523 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SORT1Q99523 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SORT1Q99523 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SORT1Q99523 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms