Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NAP1L3Q99457 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NAP1L3Q99457 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NAP1L3Q99457 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NAP1L3Q99457 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms