Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PHOX2BQ99453 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PHOX2BQ99453 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHOX2BQ99453 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHOX2BQ99453 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms