Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSF3RQ99062 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSF3RQ99062 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3RQ99062 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSF3RQ99062 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3RQ99062 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms