Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TGS1Q96RS0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TGS1Q96RS0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TGS1Q96RS0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TGS1Q96RS0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms