Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN4Q96NZ1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXN4Q96NZ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXN4Q96NZ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXN4Q96NZ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXN4Q96NZ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXN4Q96NZ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms