Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SAMD11Q96NU1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SAMD11Q96NU1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SAMD11Q96NU1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SAMD11Q96NU1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms