Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC114Q96M63 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC114Q96M63 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC114Q96M63 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC114Q96M63 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms