Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
EP400Q96L91 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EP400Q96L91 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
EP400Q96L91 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
EP400Q96L91 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EP400Q96L91 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms