Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC16BQ96JE7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC16BQ96JE7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEC16BQ96JE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEC16BQ96JE7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEC16BQ96JE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms