Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPDL1Q96EA4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDL1Q96EA4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDL1Q96EA4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDL1Q96EA4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms