Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC39Q96DD0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRRC39Q96DD0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC39Q96DD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC39Q96DD0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC39Q96DD0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms