Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EME1Q96AY2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EME1Q96AY2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EME1Q96AY2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms