Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP7Q93009 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP7Q93009 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP7Q93009 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP7Q93009 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP7Q93009 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP7Q93009 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP7Q93009 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP7Q93009 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP7Q93009 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP7Q93009 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP7Q93009 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP7Q93009 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP7Q93009 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP7Q93009 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP7Q93009 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP7Q93009 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP7Q93009 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP7Q93009 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP7Q93009 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP7Q93009 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP7Q93009 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP7Q93009 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP7Q93009 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP7Q93009 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP7Q93009 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP7Q93009 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP7Q93009 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP7Q93009 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP7Q93009 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP7Q93009 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP7Q93009 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP7Q93009 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP7Q93009 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP7Q93009 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP7Q93009 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP7Q93009 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP7Q93009 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP7Q93009 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP7Q93009 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP7Q93009 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP7Q93009 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP7Q93009 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP7Q93009 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP7Q93009 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP7Q93009 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP7Q93009 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP7Q93009 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP7Q93009 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP7Q93009 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP7Q93009 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP7Q93009 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP7Q93009 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP7Q93009 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP7Q93009 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP7Q93009 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP7Q93009 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP7Q93009 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP7Q93009 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP7Q93009 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP7Q93009 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP7Q93009 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP7Q93009 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP7Q93009 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP7Q93009 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP7Q93009 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP7Q93009 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP7Q93009 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP7Q93009 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP7Q93009 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP7Q93009 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP7Q93009 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP7Q93009 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP7Q93009 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP7Q93009 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP7Q93009 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP7Q93009 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP7Q93009 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP7Q93009 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP7Q93009 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP7Q93009 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP7Q93009 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP7Q93009 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP7Q93009 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP7Q93009 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP7Q93009 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP7Q93009 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
USP7Q93009 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP7Q93009 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP7Q93009 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP7Q93009 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP7Q93009 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms