Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEMA4DQ92854 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEMA4DQ92854 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEMA4DQ92854 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA4DQ92854 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms