Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PYDC1Q8WXC3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PYDC1Q8WXC3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PYDC1Q8WXC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms