Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEW8

PARD3B, Partitioning defective 3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD3BQ8TEW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PARD3BQ8TEW8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PARD3BQ8TEW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PARD3BQ8TEW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PARD3BQ8TEW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARD3BQ8TEW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PARD3BQ8TEW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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