Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.04■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
FAT3Q8TDW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAT3Q8TDW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FAT3Q8TDW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms