Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNIH3Q8TBE1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNIH3Q8TBE1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNIH3Q8TBE1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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