Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP35Q8NFH5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NUP35Q8NFH5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP35Q8NFH5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms