Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD12Q8N8I0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD12Q8N8I0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAMD12Q8N8I0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms