Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFT20Q8IY31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
IFT20Q8IY31 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT20Q8IY31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IFT20Q8IY31 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT20Q8IY31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms