Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SFR1Q86XK3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SFR1Q86XK3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SFR1Q86XK3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SFR1Q86XK3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFR1Q86XK3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms