Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPFIBP1Q86W92 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPFIBP1Q86W92 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPFIBP1Q86W92 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPFIBP1Q86W92 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms