Protein–RNA interactions for Protein: Q86SG6

NEK8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK8Q86SG6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEK8Q86SG6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEK8Q86SG6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEK8Q86SG6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK8Q86SG6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK8Q86SG6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEK8Q86SG6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK8Q86SG6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK8Q86SG6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEK8Q86SG6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms