Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX20Q7Z614 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX20Q7Z614 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX20Q7Z614 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX20Q7Z614 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms