Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSX8Q7RTT4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX8Q7RTT4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX8Q7RTT4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX8Q7RTT4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms