Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LINC00575Q6W349 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00575Q6W349 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00575Q6W349 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms