Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI26

SHQ1, Protein SHQ1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1Q6PI26 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SHQ1Q6PI26 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHQ1Q6PI26 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHQ1Q6PI26 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHQ1Q6PI26 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms