Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFXN4Q6P4A7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFXN4Q6P4A7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SFXN4Q6P4A7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFXN4Q6P4A7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFXN4Q6P4A7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFXN4Q6P4A7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SFXN4Q6P4A7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SFXN4Q6P4A7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFXN4Q6P4A7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SFXN4Q6P4A7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SFXN4Q6P4A7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms