Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT80Q6KB66 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT80Q6KB66 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRT80Q6KB66 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT80Q6KB66 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT80Q6KB66 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms