Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATG16L1Q676U5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATG16L1Q676U5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATG16L1Q676U5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATG16L1Q676U5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms