Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FAM46CQ5VWP2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM46CQ5VWP2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM46CQ5VWP2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM46CQ5VWP2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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