Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF38BQ5VTL8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF38BQ5VTL8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF38BQ5VTL8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF38BQ5VTL8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF38BQ5VTL8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms