Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q5VSD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q5VSD8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q5VSD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q5VSD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q5VSD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5VSD8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5VSD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5VSD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5VSD8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q5VSD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q5VSD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q5VSD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q5VSD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q5VSD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5VSD8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5VSD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5VSD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5VSD8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5VSD8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q5VSD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5VSD8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5VSD8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5VSD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5VSD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q5VSD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q5VSD8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q5VSD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5VSD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5VSD8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5VSD8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5VSD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q5VSD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q5VSD8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms