Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LIN9Q5TKA1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LIN9Q5TKA1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LIN9Q5TKA1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIN9Q5TKA1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LIN9Q5TKA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms