Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PAPPA-AS1Q5QFB9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms