Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HABP4Q5JVS0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HABP4Q5JVS0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HABP4Q5JVS0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HABP4Q5JVS0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms