Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL22Q53GT1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLHL22Q53GT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL22Q53GT1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL22Q53GT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms