Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GNPTABQ3T906 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GNPTABQ3T906 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GNPTABQ3T906 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GNPTABQ3T906 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms