Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT71Q3SY84 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT71Q3SY84 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT71Q3SY84 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT71Q3SY84 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT71Q3SY84 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms