Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SP6Q3SY56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SP6Q3SY56 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SP6Q3SY56 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SP6Q3SY56 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms