Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFX4Q33E94 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFX4Q33E94 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX4Q33E94 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.2 ms