Protein–RNA interactions for Protein: Q330K2

NDUFAF6, NADH dehydrogenase (ubiquinone) complex I, assembly factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF6Q330K2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAF6Q330K2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFAF6Q330K2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFAF6Q330K2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF6Q330K2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms