Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM16LQ309B1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM16LQ309B1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM16LQ309B1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM16LQ309B1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms