Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MICAQ29983 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MICAQ29983 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MICAQ29983 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MICAQ29983 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MICAQ29983 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MICAQ29983 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICAQ29983 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICAQ29983 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICAQ29983 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MICAQ29983 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MICAQ29983 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MICAQ29983 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MICAQ29983 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MICAQ29983 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MICAQ29983 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MICAQ29983 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MICAQ29983 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MICAQ29983 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MICAQ29983 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICAQ29983 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MICAQ29983 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MICAQ29983 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MICAQ29983 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MICAQ29983 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MICAQ29983 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MICAQ29983 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MICAQ29983 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MICAQ29983 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MICAQ29983 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MICAQ29983 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MICAQ29983 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICAQ29983 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICAQ29983 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICAQ29983 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICAQ29983 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICAQ29983 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MICAQ29983 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MICAQ29983 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MICAQ29983 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MICAQ29983 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICAQ29983 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICAQ29983 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICAQ29983 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICAQ29983 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MICAQ29983 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICAQ29983 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MICAQ29983 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MICAQ29983 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MICAQ29983 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MICAQ29983 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MICAQ29983 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MICAQ29983 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MICAQ29983 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MICAQ29983 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICAQ29983 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICAQ29983 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICAQ29983 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MICAQ29983 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MICAQ29983 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MICAQ29983 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICAQ29983 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICAQ29983 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICAQ29983 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICAQ29983 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICAQ29983 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MICAQ29983 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MICAQ29983 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MICAQ29983 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICAQ29983 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICAQ29983 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICAQ29983 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICAQ29983 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MICAQ29983 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MICAQ29983 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms