Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRF1Q16656 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRF1Q16656 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NRF1Q16656 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRF1Q16656 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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