Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FXNQ16595 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FXNQ16595 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FXNQ16595 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FXNQ16595 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FXNQ16595 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FXNQ16595 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FXNQ16595 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FXNQ16595 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FXNQ16595 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FXNQ16595 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FXNQ16595 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FXNQ16595 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FXNQ16595 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FXNQ16595 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FXNQ16595 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FXNQ16595 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FXNQ16595 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FXNQ16595 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FXNQ16595 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FXNQ16595 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FXNQ16595 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FXNQ16595 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FXNQ16595 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FXNQ16595 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FXNQ16595 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FXNQ16595 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FXNQ16595 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FXNQ16595 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FXNQ16595 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FXNQ16595 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FXNQ16595 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FXNQ16595 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FXNQ16595 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FXNQ16595 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FXNQ16595 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FXNQ16595 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FXNQ16595 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FXNQ16595 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FXNQ16595 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FXNQ16595 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FXNQ16595 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FXNQ16595 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FXNQ16595 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FXNQ16595 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FXNQ16595 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
FXNQ16595 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FXNQ16595 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FXNQ16595 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FXNQ16595 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FXNQ16595 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
FXNQ16595 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FXNQ16595 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FXNQ16595 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FXNQ16595 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FXNQ16595 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FXNQ16595 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FXNQ16595 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FXNQ16595 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FXNQ16595 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXNQ16595 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXNQ16595 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXNQ16595 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXNQ16595 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FXNQ16595 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FXNQ16595 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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