Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PKN1Q16512 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PKN1Q16512 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
PKN1Q16512 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKN1Q16512 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
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